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    PCR實驗耗材你選對了嗎?

    發布時間: 2020-08-19  點擊次數: 2717次

    聚合酶鏈式在哪反應?


    Polymerase Chain Reaction


    PCR實驗耗材你選對了嗎?



    聚合酶鏈式反應

    什么是聚合酶鏈式反應?

    聚合(he)酶(mei)鏈式反應(polymerase chain reaction,PCR)是一項用于(yu)放大擴增特定的(de)DNA片(pian)段(duan)的(de)分子生物學技術,它是在DNA聚合(he)酶(mei)和核苷酸底物共同參與下(xia),將(jiang)該段(duan)DNA擴增至足夠數量(liang),以便進(jin)行結構和功能分析。

    PCR實驗耗材你選對了嗎?


    影響PCR實驗的因素之一 —— 耗材

    在PCR實驗中,影響擴增(zeng)效果的(de)(de)因素(su)有很多。我(wo)們能想到的(de)(de)有dNTP的(de)(de)質量與(yu)濃度、模板核(he)酸的(de)(de)量與(yu)純化程度、引物的(de)(de)設計、DNA聚合酶的(de)(de)濃度、擴增(zeng)長度等問(wen)題。

    實(shi)(shi)際上,使用的耗材(cai)也可能會影響實(shi)(shi)驗(yan)結果,而這往(wang)往(wang)被我們所忽略。因此在選擇實(shi)(shi)驗(yan)耗材(cai)前,我們還需要了解PCR耗材(cai)相(xiang)關(guan)的特性和術語(yu)。


    如何選擇合適的PCR耗材

    1、原材料

    PCR/qPCR耗材(cai)一般(ban)都是聚丙烯(PP)材(cai)質。

    因其(qi)為生物學(xue)惰性材料,表面不易(yi)粘(zhan)附生物分(fen)子,且有著良好的(de)化學(xue)耐性,及溫度耐受性 (可121℃高壓滅菌(jun),也可以承受熱循環(huan)過程(cheng)中(zhong)的(de)溫度變化)。這些(xie)材料通常會(hui)與(yu)試(shi)劑或者樣品直接接觸,因而(er)在生產制備過程(cheng)中(zhong)需要選用高質量的(de)材料和良好的(de)加(jia)工工藝。


    2、選擇合適的容積

    PCR管的體積規格大多數(shu)都可(ke)以滿(man)足(zu)PCR反(fan)(fan)應要求。但是在(zai)滿(man)足(zu)實驗要求的基(ji)礎上,優先(xian)推(tui)薦選用低(di)容(rong)管。因(yin)為低(di)容(rong)反(fan)(fan)應管/板有著較(jiao)小的上方空間(jian),可(ke)提(ti)高熱傳導率并(bing)降(jiang)低(di)蒸(zheng)發(fa)。而(er)(er)且在(zai)加(jia)(jia)樣時(shi),需要避免加(jia)(jia)樣過(guo)量或過(guo)少。過(guo)量會(hui)導致熱傳導率下(xia)降(jiang),溢(yi)出及交叉(cha)污染,而(er)(er)加(jia)(jia)樣過(guo)少可(ke)能(neng)會(hui)造成樣品蒸(zheng)發(fa)損(sun)失。

    大家可依據具體的(de)實驗要求選用合(he)適的(de)產品。


    PCR實驗耗材你選對了嗎?

    品牌(pai):鋼士特GUNSTER(中國臺灣)

    名稱:PCR八聯排管(guan)(管(guan)蓋分離)

    貨號:MB-P08B

    規(gui)格(ge):0.2ml  平蓋




    PCR實驗耗材你選對了嗎?

    品牌:鋼(gang)士特GUNSTER(中國(guo)臺(tai)灣(wan))

    名稱:PCR八聯排管(管蓋分離)

    貨號:MB-P08D

    規格:0.2ml  凸蓋




    PCR實驗耗材你選對了嗎?

    品牌:鋼(gang)士特GUNSTER(中國臺灣)

    名稱:PCR 96孔(kong)板

    貨號:MB-P96

    規(gui)格:0.2ml  無裙(qun)邊  透明




    3、PCR管管蓋的選擇

    平蓋與凸蓋各有優勢:

    平蓋可(ke)為qPCR提供精確的熒(ying)光信號傳遞;便(bian)于書寫(xie)標記(ji);合蓋容易(yi),密封性好(hao),易(yi)于操作(zuo)。

    凸蓋與(yu)PCR儀(yi)熱蓋接觸(chu),減少壓力引起的反應管變形(xing),更好的防(fang)止液體蒸發。但會影響熒光信(xin)號傳遞,無法應用于qPCR實(shi)驗。



    4、96孔板裙邊的選擇

    無裙邊板:可適(shi)用(yong)于(yu)大多數(shu)的PCR儀或(huo)qPCR儀,但不適(shi)用(yong)于(yu)自動化、應用(yong)。移液過程中穩定(ding)性(xing)不高(gao),需要配(pei)合(he)板托使用(yong)。

    半(ban)裙邊板:可(ke)適配標簽或應用條(tiao)碼,適合自(zi)動化應用,且有著(zhu)較好(hao)的(de)移液(ye)穩定性。

    全裙邊板:非常(chang)適(shi)用于自動化實驗應用,也可(ke)適(shi)配標簽及應用條碼(ma)。機械強(qiang)度較好,可(ke)適(shi)用于凸(tu)出模塊的PCR儀,且(qie)移液(ye)過程中(zhong)穩定性高。



    5、根據實驗選擇耗材

    根據(ju)檢測方法的(de)不(bu)同,耗(hao)材的(de)選(xuan)擇也不(bu)同。

    PCR實驗分為(wei)普通(tong)PCR法(fa)(fa)和(he)(he)熒光定(ding)量PCR法(fa)(fa)。普通(tong)PCR法(fa)(fa)一般是(shi)終點PCR跑膠(jiao)法(fa)(fa)測定(ding),所以所用(yong)耗材(cai)的(de)導熱(re)性(xing)(xing)(xing)和(he)(he)密(mi)封性(xing)(xing)(xing)和(he)(he)實驗結(jie)果(guo)有著密(mi)不可(ke)分的(de)關系;而熒光定(ding)量PCR是(shi)實時檢測熒光信號,除了(le)導熱(re)性(xing)(xing)(xing)和(he)(he)密(mi)封性(xing)(xing)(xing)外,對(dui)透光性(xing)(xing)(xing)和(he)(he)避光性(xing)(xing)(xing)也有所要求。

    簡而(er)言之,做熒(ying)光定量PCR的耗材也可(ke)以做普通PCR,反(fan)之則不行(xing)。


    導熱性

    導熱性越好越均一,PCR的速度就越快,準確度也越高。


    密封性

    密封性越好,產物的揮發越少,得到的產物就越多,同時氣溶膠的產生也越少,對于下一輪實驗的污染也就越少,也就意味著假陽性的產生率越低。


    避光性

    這(zhe)是(shi)針對熒光定(ding)量而言的(de),如果(guo)我們在(zai)整個實驗過程中沒注意避光,帶(dai)有熒光的(de)試劑(ji)過度被消耗,那直接就會影響(xiang)我們實驗的(de)擴增效(xiao)率,導致產(chan)生不(bu)準(zhun)確的(de)結果(guo)。


    透光性

    這也是(shi)對(dui)于熒光(guang)(guang)(guang)(guang)定量(liang)而(er)言,我(wo)們(men)知(zhi)道它是(shi)一種實時定量(liang)的(de)(de)方式,那么耗材本(ben)身(shen)的(de)(de)透光(guang)(guang)(guang)(guang)性就直接關(guan)系(xi)到我(wo)們(men)檢(jian)測(ce)到的(de)(de)熒光(guang)(guang)(guang)(guang)信(xin)號多少。如果選擇(ze)耗材透光(guang)(guang)(guang)(guang)性良好,需要檢(jian)測(ce)到的(de)(de)信(xin)號就會(hui)變得(de)微弱,那就會(hui)造成我(wo)們(men)對(dui)結(jie)果的(de)(de)誤判(pan)。所以對(dui)于熒光(guang)(guang)(guang)(guang)定量(liang)而(er)言,白色(se)PCR板效果優于透明PCR板。



    PCR技術的臨床應用

    單克(ke)隆抗體技術曾(ceng)使免(mian)疫學(xue)(xue)理論與實踐有了新的(de)突(tu)破(po),近幾年來PCR技術使分子生(sheng)物學(xue)(xue)及相關學(xue)(xue)科(ke)發生(sheng)了一次方法(fa)學(xue)(xue)的(de)革(ge)命。在(zai)不到10年的(de)時間內,在(zai)以下幾個領域中PCR技術已(yi)具(ju)有實用價值,且其應用范圍正在(zai)不斷擴大中。


    1、遺傳病的產前診斷

    用胎兒(er)羊(yang)膜細(xi)胞,羊(yang)水或甚至(zhi)母(mu)血(xue)可以檢(jian)查胎兒(er)的(de)性別,這在(zai)與性染(ran)色體(ti)關聯遺傳病(bing)(bing)診斷中是(shi)必要的(de)。對(dui)于(yu)(yu)高(gao)發的(de)遺傳病(bing)(bing),如(ru)地中海貧(pin)血(xue)、鐮刀狀細(xi)胞貧(pin)血(xue)、凝血(xue)因子(zi)缺乏、DMD等已在(zai)臨(lin)床應用多(duo)年,為優生優育作了貢獻,對(dui)于(yu)(yu)有遺傳傾向(xiang)的(de)疾病(bing)(bing)尤其(qi)是(shi)老年性疾病(bing)(bing),如(ru)糖(tang)尿病(bing)(bing)、高(gao)血(xue)脂癥、甚至(zhi)腫瘤中的(de)一部分,均(jun)是(shi)當前研究的(de)重點(dian),近(jin)期內可望有突破。


    2、致病病原體的檢測

    這些外源入侵的(de)(de)(de)基(ji)因,一旦闡明其部分(fen)核酸序列(lie),就可(ke)以設(she)計(ji)引物(wu)或(huo)探針,用(yong)PCR、PT-PCR或(huo)雜交方法來檢測(ce)(ce),其范圍包括細(xi)菌(jun)、病毒、原蟲及寄(ji)生蟲、霉(mei)菌(jun)、立(li)克次體、衣原體和(he)(he)支原體等(deng)一切微生物(wu),PCR診斷的(de)(de)(de)特點是可(ke)以選擇其基(ji)因中的(de)(de)(de)保(bao)守(shou)區作(zuo)通用(yong)檢測(ce)(ce),也可(ke)以選定差異較大(da)的(de)(de)(de)基(ji)因部位(wei)作(zuo)分(fen)型(xing)檢測(ce)(ce)。既可(ke)以做一病原體的(de)(de)(de)專用(yong)檢測(ce)(ce),也可(ke)以將有關病毒、細(xi)菌(jun)中不同的(de)(de)(de)品種作(zuo)一次多元檢測(ce)(ce)。而且檢測(ce)(ce)的(de)(de)(de)靈敏度和(he)(he)特異性都(dou)遠高于(yu)(yu)當(dang)前(qian)的(de)(de)(de)免(mian)疫學(xue)方法,所需時(shi)間也已達到(dao)臨床要(yao)求,這對于(yu)(yu)難于(yu)(yu)培養的(de)(de)(de)病毒(乙肝(gan)),細(xi)菌(jun)(如結核、厭氧菌(jun))和(he)(he)原蟲(如梅(mei)毒螺旋體)等(deng)來說尤為適用(yong)。


    3、癌基因的檢測和診斷

    雖(sui)然(ran)對癌(ai)基(ji)(ji)因(yin)的(de)(de)(de)研究(jiu)大(da)部分(fen)(fen)還屬于(yu)基(ji)(ji)礎(chu)階段,但癌(ai)變是由基(ji)(ji)因(yin)變異所導(dao)致的(de)(de)(de)這一基(ji)(ji)本事實(shi)已無庸置疑,所以癌(ai)基(ji)(ji)因(yin)、抗(kang)(kang)癌(ai)基(ji)(ji)因(yin)入抗(kang)(kang)轉(zhuan)移(yi)基(ji)(ji)因(yin)的(de)(de)(de)研究(jiu),離開分(fen)(fen)子(zi)水(shui)平的(de)(de)(de)診斷手段是無法(fa)進行的(de)(de)(de),臨(lin)床上(shang)已可應用的(de)(de)(de)例子(zi)有(you)白血(xue)病殘留細(xi)胞的(de)(de)(de)定(ding)量(包括慢粒(li)和(he)急粒(li)),肺癌(ai)中P53及Rb等抗(kang)(kang)癌(ai)基(ji)(ji)因(yin)的(de)(de)(de)失活,神經質瘤N-myc基(ji)(ji)因(yin)的(de)(de)(de)激活和(he)表達。通過(guo)原位雜交觀察(cha)特定(ding)癌(ai)基(ji)(ji)因(yin)及抗(kang)(kang)轉(zhuan)移(yi)基(ji)(ji)因(yin)的(de)(de)(de)植入和(he)反義寡核(he)苷(gan)酸對強表達癌(ai)基(ji)(ji)因(yin)的(de)(de)(de)阻斷均已成(cheng)為近代基(ji)(ji)因(yin)治(zhi)療的(de)(de)(de)著眼點。


    4、DNA指紋、個體識別、親子關系鑒別及法醫物證

    這(zhe)(zhe)一(yi)部分所矚(zhu)目的(de)課題已經在某些國家取得法律認可。肌紅蛋白小衛星基(ji)因,β-珠蛋白基(ji)因、ApoB基(ji)因等的(de)多肽性和重復次數的(de)差異都被(bei)應用(yong)于(yu)鑒定,其(qi)靈敏度(du)已達(da)到(dao)一(yi)根頭發(fa)、一(yi)個細胞取得個體特征圖譜(pu),這(zhe)(zhe)一(yi)領域也已發(fa)展到(dao)骨髓(sui)或臟(zang)器移(yi)植配(pei)型及動物種系的(de)研究中(zhong)。


    5、動、植物檢疫

    靈敏、特(te)異、快(kuai)速診斷(duan)檢(jian)測方法是(shi)我(wo)國(guo)進(jin)出口口岸的門(men)衛,檢(jian)查出入國(guo)境的人員、動、植物(種畜、種籽)等(deng)是(shi)否攜帶烈(lie)性傳染病(bing)(艾滋、動物病(bing)毒(du)、植物病(bing)毒(du)等(deng))病(bing)原體,食(shi)品、飼料等(deng)是(shi)否帶沙(sha)門(men)氏菌等(deng)均(jun)需要(yao)基因診斷(duan)手段將這些病(bing)菌拒之(zhi)于國(guo)境之(zhi)外,是(shi)提(ti)高我(wo)國(guo)綜合國(guo)力的必要(yao)保證。


    6、高科技生物醫學領域中的應用

    在轉基(ji)因動植物中檢查植入基(ji)因的(de)存(cun)在。PCR技(ji)術尚可應用于基(ji)因拼接、測序等領域。





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